辨别珍珠鳖苗公母，首先观察整体体型。雌鳖的身体看起来比较厚实饱满，而雄鳖相对显得扁平一些，整体身形较薄，这是最直观的初步判断方法。
如何辨别珍珠鳖苗的公母？
检查腹甲的后端也是一个好办法。雄鳖腹甲后端的凹处比较深，而雌鳖腹甲后端的凹陷程度则较浅，这一特征在苗种阶段可能不如成体明显，但仍具有参考价值。
尾巴的形态差异最为明显。雌鳖的尾巴粗短，不会露出裙边之外，尖端摸起来比较软；而雄鳖的尾巴较细长，能够自然伸出裙边外，且尾巴质地较硬，容易辨识。
观察裙边的宽窄也能提供线索。雌鳖体后部的裙边相对较宽，显得丰满；而雄鳖后部的裙边则显得狭窄一些，这也是区分性别的一个外观特征。
可以通过背甲的形状来区分。雄鳖的背甲通常呈稍长的椭圆形，其中间的脊椎部分会稍微向外凸起。相比之下，雌鳖的背甲更接近较圆的椭圆形，中部的脊椎处则比较平凹，没有明显的隆起。