后四十回续书中对妙玉的描写提供了另一种结局线索。在第九十五回中，宝玉失玉，岫烟找妙玉扶乩寻问玉的下落，显示此时妙玉仍在贾府或与之有联系。然而到了第一一二回“妙尼遭劫”一节，贾府被盗，众贼将妙玉劫持而去。这一结局虽然与前文判词略有出入，但也印证了她最终未能善终，遭遇了劫难。
红楼梦里的妙玉最后怎么了
根据原著判词“欲洁何曾洁，云空未必空。可怜金玉质，终陷淖泥中”来看，妙玉的命运充满了讽刺。她自视高洁，追求清净，但最终的结局却是落入污秽之地。那幅画着一块美玉落在泥垢之中，正是她悲惨结局的直观隐喻，暗示了她虽拥有如金玉般高贵的品质，却无法摆脱沦落风尘或陷入泥潭的命运。
妙玉与林黛玉之间存在一种微妙的默契，这进一步佐证了替身说。在栊翠庵品茶时，黛玉坐在妙玉的蒲团上，两人言谈间互相调侃，如同二人一体。妙玉曾讥讽黛玉不懂分辨旧年雨水，这看似傲慢，实则可能是两人之间某种心照不宣的交流。这种特殊的互动模式，暗示了她们在精神层面或命运层面上的紧密联系。
从名字的角度分析，妙玉与黛玉之间也存在着神秘联系。宝玉曾给黛玉取字“颦颦”，并解释黛玉眉尖若蹙，如西方石名黛，可代画眉之墨，其实暗示黛玉是一块美玉。而妙玉的名字拆解开来，正是“美妙的玉”。两人的名字中都蕴含着“玉”的含义，只不过一个是出家人的法号，一个是入世者的名字，这在某种程度上揭示了她们的同源性。
另一种观点认为，妙玉因愤世嫉俗，不被当时社会所容，只能带发修行。在四大家族衰败之后，她被迫流落烟花巷，当起了娼妓。这种结局既符合她“欲洁何曾洁”的判词，也体现了她内心并未真正看破红尘，在世俗压力下最终未能保持清白之身，沦为了世俗所不容的牺牲品。
有一种独特的解读认为妙玉其实是林黛玉的替身。因为林家财力雄厚且林黛玉从小多病，林家为她找替身出家以免灾祸是有可能的。妙玉从小多病，买替身不管用便自己出家，这与黛玉的情况相似。此外，妙玉也是苏州人氏，祖上为读书仕宦之家，这与黛玉的身世背景高度重合，暗示两人身份的特殊关联。
在贾府没落之际，妙玉与黛玉、湘云联诗，感叹“寒塘渡鹤影，冷月葬花魂”，随后妙玉现身制止，并续写诗句鼓励二人不要过于颓废。然而贾府最终还是无可挽回地败落了。随着贾宝玉娶宝钗、黛玉泪尽而死，妙玉也不再能居住在贾府。从她的判曲来看，她最终如无瑕白玉遭泥陷，沦入风尘，这是她作为替身，在真身已死后必然要面对的肮脏尘世结局。
关于妙玉的最终去向，有一种说法参考了靖本眉批，提到她流落到瓜洲渡口，并且不得不屈从于一个年老丑陋的男子，即“红颜固不能不屈从枯骨”。这一情节与她判词中“终陷淖泥中”的描述相呼应，说明她在贾府衰败后，生活境遇急转直下，从备受尊崇的尼姑变成了受尽屈辱的流落者。