水晶的通透度通常比石榴石更高，颜色选择也更丰富，比如白水晶、粉晶、草莓晶和黄水晶等，而石榴石大多呈现红紫色调。
石榴石的形成需要经历火山爆发后的亿万年地质变迁，地下岩石在压力作用下风化，岩浆冷却后逐渐沉淀为含有不同矿物质的晶体。
水晶在地底岩洞中生长时，由于空间狭窄，常形成与柱状尖端平行的生长纹，液态状态下包裹其他矿石，吸收矿物质后结晶而成。
从功效角度看，水晶被认为磁场较强，有招财和转运的说法，而石榴石则被认为能帮助女性改善贫血问题。
石榴石属于硅酸盐类宝石，表面光泽较水晶暗淡；水晶主要成分为二氧化硅，属于石英族，光泽度更高且范围更广。
严格来说，石榴石是天然水晶的一种，但水晶的定义包含人造和天然两类，两者分类体系存在本质差异，不宜直接对比。