在光泽与透明度方面，玉髓内部是含水石英的隐性晶体，透明度比较高，呈现油脂到玻璃光泽。玛瑙则是脱水氧化硅的胶凝体，属于油脂光泽，透明度稍差于玉髓，这是两者在视觉质感上的重要差异。
玉髓、琉璃和玛瑙有什么区别？
在物质构成方面，玉髓是含水石英的隐性晶体，这一点和水晶的关系更近一些。玛瑙其实是一种特殊的玉髓，虽然都具有玉石的特点，但形成结构不同。简单来说，所有的玛瑙都是玉髓，但并非所有的玉髓都是玛瑙，后者才是更广泛的类别。
虽然玉髓和玛瑙互为姐妹玉石，组成矿物质大体相同，外表也相似，导致人们容易混淆，但二者有着本质区别。最明显的区别在于条带纹路，玉髓是没有条带状结构的隐晶质矿物，颜色单一或界限不明显；而玛瑙有明显的条带状结构，色彩层次感强。
从纹理特征来看，玛瑙和玉髓有着明显的区别。玛瑙属于隐晶质，具有非常明显的条带纹理，呈现出玻璃光泽；而玉髓属于微晶质，内部没有条带状结构，其光泽介于玻璃光泽到油脂光泽之间，外观更为均匀。
晶体结构的不同也是区分关键。玉髓的隐性晶体颗粒细腻，肉眼难以看见，多呈乳房状、钟乳状、肾状、葡萄状等产出。而玛瑙是蛋白石和隐晶质石英的条纹状块体，通常呈现出条带状、同心环状、云雾状或树枝状分布，颜色取决于所含杂质的种类及多少。
颜色表现上，琉璃色彩流云漓彩，质地晶莹剔透且光彩夺目；玛瑙色泽艳丽明快，具有天然纯正的光洁细润感；玉髓则温润细腻如脂如膏，颜色多为半透明白色、黄色、绿色及黑色等，且分布较为均匀。
琉璃是一种人造的玻璃宝石，原料是含24%二氧化铅的人造水晶，通过添加稀有金属着色，在高温下烧制而成。它与天然的玉髓和玛瑙完全不同，属于人造品，而玉髓和玛瑙则是天然形成的矿物玉石。
用途方面也有所不同。玛瑙常被用来制作护身符、容器以及各种装饰件；玉髓常用于雕琢成工艺品；而琉璃由于其特性，通常用于宫殿、庙宇、陵寝等重要建筑的装饰，也可以作为带色陶器用于艺术装饰。