如果是比较玉髓天珠和玛瑙天珠，它们的透明度差异明显。玉髓天珠透明度较高，放在光线明亮的地方观察，光线通过较多；而玛瑙天珠透明度较低。在底色分布上，玉髓天珠的底色比较均匀，颜色常常一致，不会混杂；玛瑙天珠的底色则混杂交织，常常构成各类图案，当然小体积的玛瑙天珠可能不见底色混杂的情况。
天珠和玛瑙、玉髓有什么区别？
天珠具有特殊的宗教和文化意义，主要产自西藏、尼泊尔等喜马拉雅山区，被认为是“天降石”，由藏族发现并传承至今。它表面有天然或人工纹饰，具有很高的宗教价值，被认为能带来好运、平安和财富。而玛瑙和玉髓主要用于制作饰品，如吊坠、手链、耳环等，虽然在质地、颜色和纹理上与天珠有相似之处，但缺乏天珠那种特殊的文化加持。
人工天珠的制作过程也值得了解，其主要材料就是玛瑙。工匠会先用硝酸、植物碱等对玛瑙进行酸洗、碱蚀，再在蚀化过的玛瑙上画上黑色、白色的线条，构成类似天然天珠的纹理。这与天然天珠因地壳运动形成的独特图案有着本质的区别。天然天珠图案独特，而人工天珠则是后天加工形成的图案，两者在形成原因和视觉质感上都有很大不同。
关于天珠，很多人认为它主要是由玛瑙或玉髓制成的，但实际上最正宗的天珠材质并非只有这两种。天然天珠主要是含有玉质、玛瑙的九眼石页岩，这是一种特殊的玛瑙，因为地壳运动岩浆喷出环境不同，形成了比一般玛瑙更特殊的图案和纹理。也有部分天然天珠是生物化石，所以天珠的材质来源比较复杂，不能简单等同于普通玛瑙。
从外观形态上看，天然玉髓常以乳状、钟乳状、肾状或葡萄状产出，而玛瑙常以致密的块状或片状产出，也有葡萄状、结核状等形态。在纹理方面，玉髓表面很少有条状纹理，而玛瑙常有条状或片状纹路出现。至于净度，玉髓透明度很高，内部很少会有杂质，整体看起来比较通透；相比之下，玛瑙的净度要差一些，内部常有一些包裹体出现。
首先我们要明确，玉髓和玛瑙其实都属于石英岩玉，主要成分都是二氧化硅，但它们的结构不同。玉髓是超显微隐晶质结构，表面没有条带状纹理，呈现玻璃到油脂光泽；而玛瑙是隐晶质结构，有明显的条带纹理，通常是玻璃光泽。简单来说，有玛瑙纹的就是玛瑙，没有玛瑙纹的则是玉髓，它们本质上都属于玉髓类矿物。